TNC于1998年应邀进入中国开展自然保护工作,首先在全球生物多样性热点地区之一的滇西北实施保护项目, 与云南省人民政府共同编制了《滇西北保护与发展行动计划》,制定了因地制宜的保护策略并付诸实施。从2007年起,TNC和环保部(现生态环境部)合作开展了“中国生物多样性保护远景规划”项目(即“蓝图”项目)。“蓝图”为中国政府确定了35个保护优先区域。这一成果被《中国生物多样性保护战略与行动计划(2011—2030年)》采纳,明确了我国未来20年生物多样性保护的总体目标、战略任务和优先行动。
2017年,TNC获得由北京市公安局颁发的境外非政府组织代表机构登记证书,成为由国家林业和草原局作为业务主管单位,可在全国范围内开展自然保护工作的国际自然保护组织。
近二十多年来TNC已将其保护项目逐步扩展到全国。中国TNC总部位于北京。目前在云南、四川、山东、内蒙古、浙江、上海、深圳以及长江流域开展不同类型的保护项目,并取得卓越成效。